在過去的2020年里，科學(xué)家們在癌癥檢測領(lǐng)域取得了多項(xiàng)重要的研究成果，本文中，小編就對本年度科學(xué)家們在癌癥檢測研究領(lǐng)域取得的重磅級研究成果進(jìn)行整理，分享給大家！
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【1】Nat Commun：成功繪制出關(guān)鍵5hmC生物標(biāo)志物的全基因組圖譜 有望改善人類癌癥的診斷
doi：10.1038/s41467-020-20001-w
近日，一篇發(fā)表在國際雜志Nature Communications上的研究報(bào)告中，來自芝加哥大學(xué)等機(jī)構(gòu)的科學(xué)家們通過研究繪制出了一張涵蓋多種人類組織類型的全基因組5-羥甲基胞嘧啶（5hmC）圖譜，該圖譜揭示了5hmC作為能檢測多種嚴(yán)重人類疾?。ū热绨┌Y和多種慢性疾病）的通用型生物標(biāo)志物的強(qiáng)大性能。與基因抑制標(biāo)志物5mC不同的是，5hmC是一種特殊的基因激活標(biāo)志物，其代表了參與胚胎發(fā)生調(diào)節(jié)、神經(jīng)過程和致癌過程的最普遍流行的途徑之一，這種新型圖譜的繪制或有望幫助科學(xué)家們理解誘發(fā)多種疾病的多種生物學(xué)驅(qū)動(dòng)因子，這對于開發(fā)新一代診斷檢測試劑非常重要。
研究者Chuan He教授說道，此前研究表明，5hmC或能作為一種優(yōu)秀的生物標(biāo)志物進(jìn)行包括癌癥在內(nèi)的多種人類疾病的診斷和預(yù)后評估，但缺少全身組織的圖譜或會(huì)限制我們對這一標(biāo)記及其潛在的組織特異性的全面了解。通過聯(lián)合研究，這項(xiàng)研究擴(kuò)展了我們對全局生物標(biāo)志物的理解，同時(shí)這也是研究人員所報(bào)道的最廣泛的關(guān)于5hmC修飾的人體組織圖譜，新型圖譜的繪制證實(shí)了5hmC或能作為基因體和增強(qiáng)子的普遍基因激活標(biāo)志物，其具有非常好的組織和細(xì)胞類型特異性，對于未來改善人類癌癥的早期診斷和人類慢性疾病的監(jiān)測或許至關(guān)重要。
【2】Nat Commun：新型表觀基因組平臺(tái)或有望實(shí)現(xiàn)對早期胰腺癌的準(zhǔn)確診斷
doi：10.1038/s41467-020-18965-w
近日，一篇刊登在國際雜志Nature Communications上的研究報(bào)告中，來自藍(lán)星基因公司(Bluestar Genomics)等機(jī)構(gòu)的科學(xué)家們通過研究證實(shí)了其所開發(fā)的新型平臺(tái)在檢測早期胰腺癌方面的強(qiáng)大潛力，這或有望幫助解決目前僅在美國每年都有超過6萬名被診斷為胰腺癌患者未得到及時(shí)診斷的需求。這種新型的表觀基因組平臺(tái)能通過分析簡單的血樣，并診斷患者機(jī)體血液中循環(huán)的DNA中是否存在胰腺癌細(xì)胞的DNA信息，從而就能實(shí)現(xiàn)對疾病的非侵入性精準(zhǔn)檢測，并能夠更加及時(shí)地對患者采取治療措施并提高患者的生存率。
研究者Samuel Levy表示，胰腺癌是一種致死性的疾病，目前針對大規(guī)模人群并沒有有效的篩查手段。這項(xiàng)研究中我們所開發(fā)的新技術(shù)就能為開發(fā)新型篩查手段提供基礎(chǔ)，并能為液體活檢和未來癌癥的篩查設(shè)定一種新標(biāo)準(zhǔn)。研究人員納入了307名患者（40歲及以上的患者）進(jìn)行研究，他們使用新技術(shù)識別出了成千上萬個(gè)基因的不同模式，這些模式或能充當(dāng)用于基于血液的胰腺癌檢測的生物標(biāo)志物，幫助開發(fā)新型癌癥篩查技術(shù)。
【3】Sci Rep：科學(xué)家有望盡可能早地對胰腺癌進(jìn)行診斷
doi：10.1038/s41598-020-59523-0
胰腺癌很少會(huì)在早期被發(fā)現(xiàn)，因?yàn)榛颊叩陌Y狀通常直到癌癥進(jìn)展才會(huì)表現(xiàn)出來，通常治療胰腺癌的手段包括手術(shù)、化療或放療。近日，一項(xiàng)刊登在國際雜志Scientific Reports上的研究報(bào)告中，來自密蘇里大學(xué)等機(jī)構(gòu)的科學(xué)家們通過研究發(fā)現(xiàn)，一種諸如RNA等新型的生物片段或能作為檢測早期胰腺癌的生物標(biāo)志物。
研究者Senthil Kumar教授說道，如果我們盡可能早地對胰腺癌進(jìn)行診斷，那么臨床醫(yī)生就會(huì)對患者及時(shí)采取治療措施，最終幫助改善患者的治療和預(yù)后表現(xiàn)。通過以一種微創(chuàng)的方式抽取患者的血液樣本，研究者就能對存在于血液中的外泌體進(jìn)行分析，外泌體中包含有來自正常和腫瘤細(xì)胞中不同的生物學(xué)信息。
【4】Cell：液體樣品檢測可用于癌癥的診斷
doi：10.1016/j.cell.2020.07.009
由于在早期發(fā)現(xiàn)癌癥時(shí)更容易成功得到治療，因此癌癥研究的主要目標(biāo)之一是開發(fā)新的方法，以便在腫瘤開始擴(kuò)散之前及早發(fā)現(xiàn)它們。其中一類方法是液體活檢，這些測試旨在通過檢測血液樣本中的生物標(biāo)志物來發(fā)現(xiàn)和診斷。近日，發(fā)表在Cell雜志的一項(xiàng)研究中，研究者表示，癌癥醫(yī)學(xué)中的一項(xiàng)重大任務(wù)就是根據(jù)血液檢查診斷患者是否患有早期癌癥。
以前有關(guān)液體活檢的許多工作都集中在檢測和分析癌細(xì)胞釋放到血液中的癌癥基因。這些液體活檢中的一部分，包括MSK-ACCESS，已被批準(zhǔn)為監(jiān)測治療并指導(dǎo)癌癥患者接受靶向治療。這項(xiàng)新的研究重點(diǎn)不是分析基因，而是檢查EVP中包含的蛋白質(zhì)。研究者指出，腫瘤可能釋放EVP，以此作為準(zhǔn)備身體其他部位擴(kuò)散時(shí)接受癌細(xì)胞的一種方式。
【5】Nat Commun：新技術(shù)提早4年診斷癌癥！中外科學(xué)家開發(fā)突破性癌癥早期診斷技術(shù)！
doi：10.1038/s41467-020-17316-z
一個(gè)包括復(fù)旦大學(xué)、山東大學(xué)、加州大學(xué)圣地亞哥分校、鹍遠(yuǎn)基因等機(jī)構(gòu)的研究團(tuán)隊(duì)開發(fā)了一種非侵入性血液測試，可以檢測一個(gè)人是否患有五種常見癌癥（胃癌、食道癌、結(jié)直腸癌、肺癌和肝癌），且可以比目前的癌癥診斷方法早四年檢測出癌癥。相關(guān)研究成果發(fā)表在Nature Communications上。這項(xiàng)被稱為PanSeer的ctDNA甲基化多癌篩查技術(shù)可以在收集樣本時(shí)無癥狀且僅在一到四年后被診斷為癌癥的個(gè)體中檢測出91%的癌癥樣本。此外，在收集樣本時(shí)已經(jīng)確診的113名患者中，該檢測準(zhǔn)確地檢測出了88%的癌癥。該測試也識別出95%的無癥狀癌癥樣本。該技術(shù)由鹍遠(yuǎn)基因原創(chuàng)研發(fā)。
這項(xiàng)研究的獨(dú)特之處在于，研究人員獲得了尚未確診的無癥狀患者的血樣。這使得研究小組能夠開發(fā)出一種比傳統(tǒng)診斷方法更早發(fā)現(xiàn)癌癥標(biāo)志物的檢測方法。這些樣本是復(fù)旦大學(xué)2007年開展的一項(xiàng)為期10年的縱向研究的一部分。研究人員的最終目標(biāo)是在每年的健康檢查中進(jìn)行例行的血液檢測。但目前的重點(diǎn)是根據(jù)家族史、年齡或其他已知的風(fēng)險(xiǎn)因素，檢測高風(fēng)險(xiǎn)人群。
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【6】Nature子刊：基于ctDNA的液體活檢技術(shù)在癌癥診斷中的應(yīng)用進(jìn)展！
doi：10.1038/s43018-020-0043-5
近日，一項(xiàng)刊登在國際雜志Nature Cancer上題為“Circulating tumor DNA and liquid biopsy in oncology”的綜述報(bào)告中，來自多倫多大學(xué)的科學(xué)家們深入分析了循環(huán)腫瘤DNA和腫瘤液體活檢的研究進(jìn)展。如今利用分析循環(huán)腫瘤DNA（ctDNA）來檢測及監(jiān)測癌癥的技術(shù)越來越成熟，而且越來越多的研究證據(jù)揭示了該技術(shù)在診斷測試中的能力，ctDNA液體活檢在實(shí)體瘤和惡性血液癌癥中的診斷、特性分析及管理中的全部潛力將通過評估臨床實(shí)用性的介入性臨床試驗(yàn)來揭示，這篇綜述報(bào)告匯總，研究人員討論了ctDNA液體活檢在癌癥檢測中的應(yīng)用以及未來臨床應(yīng)用的前景。
文章中，研究人員從以下幾方面進(jìn)行了闡述，1）轉(zhuǎn)移性實(shí)體瘤中的ctDNA；2）免疫療法反應(yīng)的基因組關(guān)聯(lián)性；3）從臨床試驗(yàn)到臨床應(yīng)用；4）ctDNA的動(dòng)態(tài)變化和療法反應(yīng)；5）獲得性耐藥性的識別和特性分析；6）癌前診斷和篩查；7）引入基于ctDNA的癌癥篩查；8）基于ctDNA的臨床試驗(yàn)設(shè)計(jì)等。研究者表示，建立基于ctDNA的癌癥篩查或?qū)⑿枰獙⒅T如此類檢測技術(shù)整合到現(xiàn)有的臨床護(hù)理治療中去，由于相關(guān)危害會(huì)相對減少，因此癌癥風(fēng)險(xiǎn)較高的人群通常會(huì)接受初級癌癥篩查。比如，癌癥易感性基因種系突變的人群通常要接受密集性的篩查程序，包括定期體檢、血液檢查和醫(yī)學(xué)成像等。同樣地，研究人員還建議人們在限定的年齡范圍內(nèi)進(jìn)行子宮頸癌的篩查從而提高篩查試驗(yàn)的陽性預(yù)測值，這些設(shè)置對于評估基于ctDNA的篩查策略或許是理想的，因?yàn)楝F(xiàn)有的試驗(yàn)具有能夠形成進(jìn)行比較的基礎(chǔ)性特征。
【7】Cell：科學(xué)家開發(fā)出一種新型的血液檢測手段 或能有效改善對肝癌人群的篩查
doi：10.1016/j.cell.2020.05.038
近日，一項(xiàng)刊登在國際雜志Cell上的研究報(bào)告中，來自美國國家癌癥研究所等機(jī)構(gòu)的科學(xué)家們通過研究開發(fā)出了一種新型檢測手段，其能幫助識別更有可能患上肝細(xì)胞癌（HCC， hepatocellular carcinoma）的人群。肝細(xì)胞癌是一種最常見的肝癌類型，這種新方法能利用簡單的血液檢測手段來檢查患者此前是否暴露于特定的病毒感染中。
研究者Xin Wei Wang說道，與當(dāng)前的篩選手段結(jié)合在一起時(shí)，這種新型檢測手段在篩查HCC風(fēng)險(xiǎn)人群中扮演著非常重要的角色，其能幫助臨床醫(yī)生盡可能早地發(fā)現(xiàn)和并治療HCC。這種新方法相對簡單且便宜，僅需要患者少量的血液樣本就能進(jìn)行檢測。
【8】Clin Cancer Res：突破！新型血液檢測技術(shù)或能更早地實(shí)現(xiàn)胰腺癌的診斷！
doi：10.1158/1078-0432.CCR-19-3313
近日，一篇發(fā)表在國際雜志Clinical Cancer Research上的研究報(bào)告中，來自賓夕法尼亞大學(xué)Perelman醫(yī)學(xué)院等機(jī)構(gòu)的科學(xué)家們通過研究開發(fā)了一種新型的血液檢測手段，其不僅能夠檢測尚處于早期階段的常見胰腺癌，還能幫助臨床醫(yī)生準(zhǔn)確評估患者的疾病進(jìn)展階段及對患者進(jìn)行最佳的治療。在盲法研究中，相比其它任何的生物標(biāo)志物而言，這種新型的液體活檢技術(shù)能夠進(jìn)行更為準(zhǔn)確地檢測，同時(shí)還能比單獨(dú)使用成像技術(shù)而言更加準(zhǔn)確地對患者的疾病進(jìn)行分期。
胰腺導(dǎo)管腺癌（PDAC，Pancreatic ductal adenocarcinoma）是一種最常見的胰腺癌，其是癌癥患者死亡的第三大原因，患者總體的5年生存率僅為9%，大部分患者在確診后存活時(shí)間不足一年。目前針對這種癌癥最大的挑戰(zhàn)之一就是如何在疾病進(jìn)展或擴(kuò)散之前對其準(zhǔn)確發(fā)現(xiàn)，如果發(fā)現(xiàn)的早，患者或許會(huì)選擇外科手術(shù)來移除腫瘤，而且這或許是可以治愈的。對于局部疾病進(jìn)展的患者而言，即癌癥除了胰腺外并不會(huì)進(jìn)行擴(kuò)散，但根據(jù)腫瘤的大小和位置并不適合進(jìn)行手術(shù)的患者。
【9】Nature：科學(xué)家成功利用機(jī)器學(xué)習(xí)技術(shù)對肺癌患者進(jìn)行早期診斷
doi：10.1038/s41586-020-2140-0
日前，一項(xiàng)刊登在國際雜志Nature上的研究報(bào)告中，來自斯坦福大學(xué)等機(jī)構(gòu)的科學(xué)家們通過研究或有望利用機(jī)器學(xué)習(xí)手段來檢測人類患者機(jī)體中的早期肺癌。文章中，研究人員分析并檢測了這種機(jī)器學(xué)習(xí)系統(tǒng)，以及其尋找血液樣本中的循環(huán)腫瘤DNA（ctDNA）的能力。
肺癌是一種最常見的致死性癌癥，與很多癌癥一樣，肺癌發(fā)現(xiàn)得越早，患者的生存機(jī)會(huì)就越大。但很不幸的是，目前研究人員僅能通過CT掃描來對肺癌進(jìn)行診斷，這種檢測手段不僅昂貴而且假陽性率較高，基于這一原因，研究人員一直想通過研究開發(fā)出能在早期階段對肺癌進(jìn)行診斷的血液檢測手段。
【10】Nat Biotechnol：科學(xué)家開發(fā)出有望加速癌癥診斷的新技術(shù)—scTRIP
doi：10.1038/s41587-019-0366-x
近日，一項(xiàng)刊登在國際雜志Nature Biotechnology上的研究報(bào)告中，來自歐洲分子生物學(xué)實(shí)驗(yàn)室等機(jī)構(gòu)的科學(xué)家們通過研究開發(fā)了一種便宜快速的方法來檢查單一細(xì)胞中的遺傳差異。就能夠接收到的信息而言，該方法的性能優(yōu)于現(xiàn)有的技術(shù)，這種新方法有望成為單細(xì)胞研究的新標(biāo)準(zhǔn)，并有望用于對包括癌癥在內(nèi)的多種疾病進(jìn)行臨床診斷。
研究者Ashley Sanders說道，我們所開發(fā)的新方法能對單一細(xì)胞的遺傳改變進(jìn)行研究。這種稱之為單細(xì)胞三通道處理（scTRIP，single cell tri-channel processing）的技術(shù)能幫助研究單細(xì)胞中DNA的遺傳變異，并能直接測定單細(xì)胞中所產(chǎn)生的遺傳突變。相比僅檢測基因組中大規(guī)模改變的現(xiàn)有方法而言，scTRIP技術(shù)能夠發(fā)現(xiàn)細(xì)胞中所發(fā)生的小規(guī)模改變以及利用其它單細(xì)胞方法無法觀察到的多種類型的遺傳變異。
