2020，一場突如其來的疫情，讓整個人類世界再次意識到了防控體系建設(shè)的重要性。防大于治，這一點對于長期威脅人類健康的癌癥而言，同樣適用。為此，9月9日-9月29日，華大智造攜手丁香園，聯(lián)合安可濟(jì)生物、裕策生物、拓普基因、海普洛斯、圣庭生物等腫瘤基因檢測公司，共同在線上舉辦了2020高通量測序腫瘤專題研討會。
本次線上會議跨時20天，共邀請了37位專家，組織了14場精彩報告和4場圓桌討論，針對BRCA、早篩、免疫與生信算法、TMB和腫瘤大Panel、腫瘤原發(fā)灶不明癌等6大問題，對腫瘤基因檢測產(chǎn)品的本土化發(fā)展、臨床路徑以及產(chǎn)業(yè)化道路進(jìn)行了探討。
問題1：疫情時代，如何做好腫瘤防控體系建設(shè)？面對突發(fā)疫情，將精準(zhǔn)檢測與診斷提到與臨床搶救同等重要位置，為疑似病例檢測、高危人群排查提供精準(zhǔn)的科學(xué)判斷，使得疫情在全國范圍內(nèi)得到了及時、有效的控制。華大智造COO蔣慧研究員表示，這離不開我國在疫情期間核酸檢測能力的大幅提升，也離不開本土化的自動化核酸檢測設(shè)備和解決方案的快速到位。圣庭生物聯(lián)合創(chuàng)始人谷紅倉教授認(rèn)為，與核酸檢測能力建設(shè)相比，在疫情時代，腫瘤基因檢測的自動化解決方案也很重要。這是因為，大多數(shù)的腫瘤患者都很難接受因疫情或突發(fā)事件而導(dǎo)致停藥的風(fēng)險。海普洛斯創(chuàng)始人兼CEO許明炎博士則指出，這次疫情暴露了全球醫(yī)療體系的現(xiàn)存短板。在全國范圍內(nèi)的腫瘤基因檢測能力和核酸檢測能力，都存在著一定的區(qū)域性差異，亟需加強(qiáng)整個防控體系的建設(shè)。安可濟(jì)生物董事長應(yīng)康博士表示，中國企業(yè)的責(zé)任與擔(dān)當(dāng)，以及在這次疫情中的積極響應(yīng)，為疫情防控做出了重要貢獻(xiàn)。同樣的道理，面向腫瘤基因檢測的儀器設(shè)備和試劑耗材也不能過度依賴海外市場，這樣才能在特殊情況下，召之即來，來之能戰(zhàn)，戰(zhàn)之能勝。從這一點來看，自主可控的國產(chǎn)測序平臺，已成為越來越多腫瘤基因檢測企業(yè)的首選平臺。問題2：聚焦BRCA，如何做好女性腫瘤精準(zhǔn)治療？
乳腺癌是女性常見的惡性腫瘤之一，發(fā)病率位居女性惡性腫瘤的首位。中山大學(xué)附屬第一醫(yī)院甲狀腺乳腺外科邵楠教授指出，基于乳腺癌全面基因組測序的現(xiàn)狀，選擇準(zhǔn)確可靠的高通量測序平臺繪制全面的分子信息是實現(xiàn)乳腺癌精準(zhǔn)治療的前提。而如今，國產(chǎn)測序平臺已經(jīng)走在行業(yè)前列，成為準(zhǔn)確可靠的代名詞。中國醫(yī)學(xué)科學(xué)院腫瘤醫(yī)院乳腺外科齊立強(qiáng)教授表示，Oncotype Dx已通過大量的臨床試驗證明其在乳腺癌預(yù)后復(fù)發(fā)風(fēng)險預(yù)測和化療獲益方面的作用，已被寫入多個臨床指南。拓普基因一直致力于乳腺癌診療領(lǐng)域，基于中國族群開發(fā)的評估模型目前正在開展多項臨床試驗，期待未來能夠讓更多中國患者精準(zhǔn)獲益。河北醫(yī)科大學(xué)第四醫(yī)院腫瘤內(nèi)科史健教授認(rèn)為，越來越多的腫瘤基因檢測的基礎(chǔ)數(shù)據(jù)與臨床證據(jù)顯示，PARP抑制劑不僅對于BRCA突變?nèi)巳河酗@著臨床獲益，對于更大范圍的HRD/HRR人群的也存在臨床獲益。拓普基因研發(fā)副總裁施玉健博士總結(jié)道，面向女性腫瘤精準(zhǔn)治療，拓普基因整合基于DNBSEQ平臺和已發(fā)表中國人群的BRCA研究數(shù)據(jù)，在 2020 年 7 月上線了中文版 BRCA 基因解讀數(shù)據(jù)庫——EasyBRCA，希望能為女性腫瘤患者提供更多助力。問題3：本土化的腫瘤基因檢測產(chǎn)品，路在何方？
早發(fā)現(xiàn)、早治療，在手術(shù)可以根治的時候，甚至在癌前病變發(fā)生之際就予以干預(yù)，被公認(rèn)為腫瘤防控的最佳措施。利用高通量測序技術(shù)，通過腫瘤基因檢測進(jìn)行早篩和風(fēng)險評估，促進(jìn)了腫瘤防控體系的完善。中國非公立醫(yī)療機(jī)構(gòu)協(xié)會病理學(xué)?？莆瘑T會主任委員朱明華教授表示，隨著人工智能的發(fā)展，對健康人群和腫瘤患者的測序數(shù)據(jù)進(jìn)行機(jī)器學(xué)習(xí)/深度學(xué)習(xí)，能夠為腫瘤的早期篩查和診斷提供更準(zhǔn)確的判斷依據(jù)。上海市胸科醫(yī)院檢驗科主任婁加陶教授認(rèn)為，與傳統(tǒng)的腫瘤標(biāo)記物相比，基于高通量測序技術(shù)的腫瘤液體活檢技術(shù)的敏感性更優(yōu)，但其臨床應(yīng)用要做到規(guī)范先行，準(zhǔn)確先行才能行穩(wěn)致遠(yuǎn)。至于如何更加高效識別高危人群，提高其依從性，同時彌補(bǔ)高危人群中早期肝癌篩查技術(shù)與方法的缺陷與不足，海軍軍醫(yī)大學(xué)第三附屬醫(yī)院肝膽內(nèi)科主任胡和平教授指出，高通量測序技術(shù)帶來了更多可能。利用DNBSEQ測序平臺，浙江大學(xué)醫(yī)學(xué)院附屬婦產(chǎn)科醫(yī)院副院長程曉東教授目前正在與安可濟(jì)生物合作開展卵巢癌早診早篩的研發(fā)項目。他期待在形成有效的檢測試劑盒并進(jìn)行院內(nèi)應(yīng)用后，聯(lián)合申報IVD，使得該試劑盒能推廣應(yīng)用到全國范圍內(nèi)，讓更多的腫瘤患者受益。安可濟(jì)控股有限公司創(chuàng)始人應(yīng)康博士則表示，腫瘤早診早篩技術(shù)性能和產(chǎn)品性能需要通過大規(guī)模臨床研究加以證明，這是耗資巨大的工程，需要謹(jǐn)慎對待。沒有高性能的檢測技術(shù)和生物信息分析能力，再多的樣本也找不出有效的客觀規(guī)律。由此應(yīng)康博士呼吁業(yè)內(nèi)同行加強(qiáng)合作，攜手與國際同行競爭并爭取勝利。問題4：臨床醫(yī)生需要什么樣的腫瘤Panel設(shè)計與生信算法開發(fā)？
如何提高腫瘤變異檢測的準(zhǔn)確率？這一點與腫瘤Panel的產(chǎn)品設(shè)計以及生信算法開發(fā)密切相關(guān)。深圳市人民醫(yī)院許瑞蓮教授指出，Panel的設(shè)計涉及大小涵蓋的基因、可檢測的變異類型等細(xì)節(jié)，精準(zhǔn)的panel設(shè)計讓檢測結(jié)果更精準(zhǔn)，更有臨床指導(dǎo)意義。深圳市龍華區(qū)人民醫(yī)院何秋山教授表示，利用更精準(zhǔn)的生信算法分析出超低頻的基因變異帶給給患者獲益的希望。廣州醫(yī)科大學(xué)附屬第三醫(yī)院魏立平教授則強(qiáng)調(diào)，腫瘤基因檢測背后的技術(shù)復(fù)雜性超出了想象，臨床上需要更多透徹的了解各個關(guān)鍵環(huán)節(jié)。深圳市人民醫(yī)院何婉教授認(rèn)為，臨床醫(yī)生需要全面的檢測信息來決策治療方案，需要涵蓋最全面的免疫治療相關(guān)標(biāo)志物的相關(guān)產(chǎn)品。海普洛斯生信研發(fā)副總監(jiān)周衍慶博士表示，利用DNBSEQ測序平臺進(jìn)行高深度測序后得到的腫瘤測序數(shù)據(jù)質(zhì)量非常好，加之海普洛斯開發(fā)的生信算法，可以準(zhǔn)確識別變異基因，包括極低頻的變異位點。問題5：如何看待腫瘤大Panel的IVD注冊發(fā)展前景和臨床路徑？
在今年上半年，基于高通量測序技術(shù)的多款液體活檢伴隨診斷大Panel產(chǎn)品獲批FDA。對此，中國醫(yī)學(xué)科學(xué)院腫瘤醫(yī)院石遠(yuǎn)凱教授表示，大Panel檢測有助于免疫綜合評估，為TMB檢測提供了更多的可能：檢測得越多，越能看到腫瘤突變負(fù)荷的全貌。
但是，TMB在檢測過程中也會受到一些因素的影響，包括檢測樣本生物學(xué)特征，檢測前標(biāo)本的建立、測序的技術(shù)路線、生信分析、預(yù)期用途等。中國食品藥品檢定研究院曲守方研究員指出，生物學(xué)方面包括樣本的類型、腫瘤的類型等；分析前包括樣本的固定方法等；測序方面包括DNA捕獲區(qū)域、panel大小、富集方法等；生信分析包括突變類型、胚系突變的過濾等；閾值設(shè)定主要包括樣本的類型、腫瘤類型、使用方法等。每個環(huán)節(jié)都非常重要，需要有標(biāo)準(zhǔn)化操作流程，才能保證結(jié)果的準(zhǔn)確性。
裕策生物創(chuàng)始人兼CEO高志博博士認(rèn)為，TMB在臨床指導(dǎo)意義上和適應(yīng)證有很大的相關(guān)性，到底選擇哪一個適應(yīng)證，前期的探索非常重要。裕策生物基于國產(chǎn)測序平臺，開發(fā)了自己的芯片，同時開發(fā)了相應(yīng)的TMB的檢測算法，在眾多的樣本里去評價，和WES的檢測結(jié)果高度一致，同時也獲得了TMB檢測的發(fā)明專利。
問題6：如何看待原發(fā)灶不明癌潛在治療靶點的臨床研究路徑？
原發(fā)灶不明癌（Cancers of Unknown Primary，以下簡稱CUP）是一種相對常見的臨床疾病，占所有浸潤性癌的4%-5%。該類腫瘤生物學(xué)表現(xiàn)各異，異質(zhì)性較強(qiáng)。這一特征令傳統(tǒng)的檢測方法往往存在局限性，同時也給臨床研究的設(shè)計和解讀帶來了不小的困難。杭州市腫瘤醫(yī)院丁紀(jì)元教授表示，越來越普遍的高通量測序技術(shù)對部分CUP患者的檢出率得到了提升，但目前暫時缺乏大規(guī)模前瞻性、隨機(jī)對照性臨床試驗的證據(jù)支持。圣庭生物谷紅倉教授指出，基因表達(dá)譜測序、甲基化檢測等高通量測序技術(shù)對于鑒別腫瘤組織起源具有較好的性能，為實現(xiàn)CUP的精準(zhǔn)診療帶來了希望。浙江大學(xué)附屬第一醫(yī)院樊龍江教授利用大型腫瘤基因表達(dá)數(shù)據(jù)庫，開發(fā)了一種用于分析腫瘤組織起源的生物信息學(xué)工具——TOD-CUP算法，對腫瘤原發(fā)部位判斷準(zhǔn)確率高達(dá)96.0%。“利用高通量測序技術(shù)和生信分析算法對CUP展開大規(guī)模臨床研究，開發(fā)CUP腫瘤溯源基因檢測產(chǎn)品，有助于臨床醫(yī)生制定針對性的治療方案?！笔锥坚t(yī)科大學(xué)附屬北京朝陽醫(yī)院病理科主任夏成青總結(jié)道，“隨著生物技術(shù)在醫(yī)學(xué)領(lǐng)域的快速發(fā)展和人們在細(xì)胞分子水平對腫瘤發(fā)病機(jī)制認(rèn)識的深入，腫瘤診療已經(jīng)進(jìn)入了全新的基因組時代?！?/span>高通量測序技術(shù)和國產(chǎn)測序平臺的發(fā)展，為癌癥早期檢測診斷以及將精準(zhǔn)醫(yī)學(xué)引入臨床實踐鋪平了道路。在這個過程中，既需要好的技術(shù)標(biāo)準(zhǔn)和行業(yè)規(guī)范，也需要類似CSCO學(xué)術(shù)年會和高通量測序技術(shù)腫瘤專題研討會這類活動帶來的廣泛的行業(yè)討論，從而對這個行業(yè)的長期良性發(fā)展產(chǎn)生深遠(yuǎn)的意義和影響。
